EpiPvr (R package)

Contexte

Développé dans le cadre d’un projet Cambridge / WAVE pour fournir des outils reproductibles d’estimation de paramètres à partir de données expérimentales et de laboratoire.

Problème

Les chercheurs ont besoin d’outils standards et reproductibles pour estimer paramètres épidémiologiques clés (taux d’infection, latence, virulence) à partir de séries temporelles expérimentales.

Solution

EpiPvr est un package R open-source offrant :

• fonctions d’estimation, diagnostics et visualisation ;
• workflows reproductibles pour l’analyse de jeux de données expérimentaux ;
• documentation et vignettes pour prise en main.

Liens & DOI

• CRAN / DOI : https://doi.org/10.32614/CRAN.package.EpiPvr
• Utilisateurs : chercheurs et épidémiologistes.

Impact

• Standardisation des analyses en laboratoire ;
• Facilitation des publications et comparaisons entre études.